La Llei 22/1998, de 30 de desembre, de la Carta municipal de Barcelona, i el Decret 84/2002, de 5 de febrer, de constitució del Consorci d'Educació de Barcelona i aprovació dels seus estatuts, han establert la seva estructura bŕsica de funcionament i organització, que queda de la següent forma:
El govern del Consorci
El Consell de Direcció del Consorci d'Educació de Barcelona, com a òrgan de govern superior, es compon actualment dels membres titulars següents, nomenats per les administracions consorciades:
- Presidenta
- Sra. M. Jesús Mier Albert
- Vicepresident
- Sr. Gerard Ardanuy Mata
- Vocals en representació de la Generalitat
- Sr. Alberto del Pozo Ortíz
Sr. Miquel García Casaponsa
Sra. Teresa Pijoan Balcells
Sr. Jordi Roig Viñals
Sra. Meritxell Ruiz Isern
- Vocals en representació de l'Ajuntament
- Sr. Jaume Ciurana Llevadot
Sra. Marta Clari Padrós
Sr. Manel Medeiros Pérez - Interventor
- Sr. Josep Lluís Àvila López
- Secretari
- Sr. Ignasi Fernández Solé
Organigrama

- Gerent
- Sr. Manel Blasco Legaz
- Gabinet de gerència
- Sr. Manuel Fernández Pérez
- Òrgan de Control Intern
- Sr. J. Ignasi Pérez Torio
- Direcció de Recursos i Organització
- Sr. Ignasi Fernández Solé
- Serveis Jurídics
- Sr. Carmelo Guiu Espinosa
- Coordinació TIC
- Sr. Francesc Olabarri Fernández
- Àrea de Recursos Econòmics
- Sra. Anna Navarro Batet
- Àrea de Recursos Humans
- Sr. Miquel García Gazquez
- Àrea d'Organització i Serveis Generals
- Sra. Montse Simón Martín
- Direcció de Centres
- Sra. Carme Massa Solé
- Programació i suport a l'escolarització
- Sra. Àngels Rodríguez Gutiérrez
- Àrea d'Educació Infantil i Primària
- Sr. Jose Luis Castel Baldellou
- Àrea d'Educació Secundària
- Sr. Francisco Peralta Tagueña
- Àrea d'Equipaments Educatius
- Sr. Oscar Marín Fraile